המתווה החדש שמציעה שרת המשפטים איילת שקד להחלת החקיקה הישראלית על המתנחלים בשטחים מהווה למעשה המשך של מיסוד שתי מערכות חוק נפרדות ומפלות ליהודים ולפלסטינים בשטחים הכבושים. במשך חמישה עשורים הלכה והעמיקה האפליה השיטתית נגד האוכלוסייה הפלסטינית, והיא נוגעת לכל תחומי החיים – דיני תעבורה, הדין הפלילי, תכנון ובניה, חופש התנועה ועוד (להרחבה ראו דוח האגודה – "שלטון אחד, שתי מערכות חוק").
כביכול, ריבונות המפקד הצבאי חלה על כל שטחי הגדה מתוקף היותם שטח כבוש. אלא שבפועל, חוק צבאי ופוגעני חל על הפלסטינים, בעוד המתנחלים נהנים מהזכויות ומהזכאויות שמעניק החוק הישראלי. המתווה של שקד חושף את מראית העין של ריבונות המפקד הצבאי על כלל תושבי הגדה, וממסד עוד יותר את האפליה ואת ההפרדה על בסיס אתני-לאומי.
